根系与土壤微生物
植物根系周围生活着许多细菌、真菌和其他微生物，它们参与有机物分解、养分转化和根际环境变化，对植物生长可能产生帮助或影响。
根瘤菌与豆科植物
部分豆科植物能够与根瘤菌建立共生关系，根瘤菌在根部形成根瘤并把空气中的氮转化为植物可以利用的含氮化合物，植物则为细菌提供有机物和生活空间。
并不是所有根部小疙瘩都是根瘤，也不是所有豆科植物在任何土壤中都能形成有效根瘤，判断时需要结合植物种类和根部结构。
菌根与植物根系
菌根是某些真菌与植物根系形成的共生结构，真菌菌丝可以延伸到根系难以到达的土壤孔隙，帮助植物获取部分水分和磷等养分，植物则向真菌提供有机物。
菌根关系会受到植物种类、土壤条件和管理方式影响，家庭盆栽不应把任何白色菌丝都直接判断为有益菌根。
如何保护根际环境
- 使用洁净且结构合适的盆土。
- 避免长期积水和频繁使用高浓度药剂。
- 换盆时尽量减少对健康根系的破坏。
- 发现异常菌落、异味或烂根时先判断是否为病害。